La SAA, après avoir été secrétée au niveau du foie, est présente dans le plasma liée à des lipoprotéines et est finalement dégradée en protéine AA ou amyloïde qui se dépose au niveau des tissus.

Lors de lésions tissulaires ou lors de certaines pathologies (pathologies chroniques, tumeurs), des médiateurs chimiques stimulent la fabrication de SAA par les hépatocytes.
La concentration sérique de SAA peut alors augmenter fortement.

Certains auteurs américains ont tenté d'explorer la valeur diagnostique de la concentration sérique de la SAA chez le chat Abyssin, mais ne sont pas parvenus à distinguer une différence significative entre les chats atteints d'amyloïdose et les chats sains.

Chez l'Abyssin, le dépôt d'amyloïde se fait au niveau de la médullaire du rein. Le rein peut en effet anatomiquement et fonctionnellement être divisé en une corticale et une médullaire.

La corticale est la couche extérieure où sont situées les unités qui filtrent le sang, alors que la médullaire située au centre du rein est essentiellement constituée des " tubes" dans lesquels ont lieu les phénomènes complexes aboutissant à la formation de l'urine.
Chez l'homme et le chien, le dépôt d'amyloïde se fait préférentiellement dans la corticale et se traduit de façon précoce par une fuite de protéines dans l'urine.